结果文件说明

以下是输出目录结构:每一行代表一个文件或文件夹,用 "├──" 表示,数字表示重要的输出文件。

./
├── outs
│   ├── filtered_feature_bc_matrix              1      ├── barcodes.tsv.gz
│      ├── features.tsv.gz
│      └── matrix.mtx.gz
│   ├── filtered_peaks_bc_matrix                2      ├── barcodes.tsv.gz
│      ├── features.tsv.gz
│      └── matrix.mtx.gz
│   ├── raw_feature_bc_matrix                   3      ├── barcodes.tsv.gz
│      ├── features.tsv.gz
│      └── matrix.mtx.gz
│   ├── raw_peaks_bc_matrix                     4      ├── barcodes.tsv.gz
│      ├── features.tsv.gz
│      └── matrix.mtx.gz
│   ├── demo_A_fragments.tsv.gz                 5   ├── demo_A_fragments.tsv.gz.tbi             6   ├── demo_A_mem_pe_Sort.bam                  7   ├── demo_A_peaks.bed                        8   ├── demo_E_SortedByName.bam                 9   ├── demo.rds                                10   ├── demo_report.html                        11   └── demo_summary.csv                        12
└── analysis
  1. 转录组细胞稀疏矩阵

  2. ATAC 细胞稀疏矩阵

  3. 转录组原始稀疏矩阵

  4. ATAC 原始稀疏矩阵

  5. fragments 文件

  6. fragments 文件索引

  7. ATAC 的 bam 文件

  8. peaks 文件

  9. 转录组的 bam 文件

  10. rds格式的样本结果

  11. 样本的html报告

  12. 样本的csv格式质控信息